本剧场版紧接TV版第27话在27话良太郎一行人为了追踪异魔神而回到过去，但他们却不知道自己已经落入了牙王的圈套当良太郎等人消灭完异魔神并想回到Den-Liner的时侯，却发现Den-Liner已经被牙王劫持……众人被逼留在过去，最坏的情况是良太郎失去了成为电王的所有记忆，桃泰诺斯也因此不能附上良太郎的身体在机缘巧合下，良太郎遇到10岁时的良太郎（剧中用小太郎代替）和异魔神齐格，并且在樱井的帮助下，开始了追踪Den-Liner之旅。另一方面，回到江户时代的牙王成功夺得神之列车Gao-Liner，且抓住了追踪到来的良太郎，并坐着Gao-Liner回到1988年12月26日。在1988年，良太郎恢复了记忆，但被牙王阻挠而不能变身。正当此时，樱井带同救兵出现，救兵则是三个不同时间的良太郎。于是，四个不同形态的电王同时出现，最Climax的战斗即将展开……
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